上海干熱滅菌器利用高溫干熱對微生物有氧化，蛋白質變性，電介質濃縮引起中毒等作用。其中主要是通過氧化作用破壞細胞原生質，使微生物死亡，所以在一定的加熱時間內可殺死一切微生物。上海干熱滅菌器的具體操作流程如下：
    一、打開門放入需要滅菌的金屬器械、玻璃器械（洗凈抹干）；
    二、接通電源； 
    三、打開滅菌器電源開關；
    四、將滅菌器門關閉； 
    五、選擇模式：例（210度）按210度鍵，然后按確認鍵，此時滅菌程序開啟；其他物品滅菌如例一樣，請選擇滅菌模式；如果滅菌過程中出現超高溫報警，請立即關閉滅菌程序或關閉電源開關。 
    六、滅菌完畢后冷卻系統自動啟動； 
    七、約18分鐘后滅菌完成，顯示屏顯示滅菌完畢（有提示音），然后關閉電源開關，稍后取物； 
    八、取物時小心燙傷。